Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR1Q15399 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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