Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDCD1Q15116 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDCD1Q15116 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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