Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
GAPVD1Q14C86 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GAPVD1Q14C86 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms