Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms