Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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