Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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