Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEMA3AQ14563 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEMA3AQ14563 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SEMA3AQ14563 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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