Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SCGB2A2Q13296 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms