Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LMAN2Q12907 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LMAN2Q12907 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LMAN2Q12907 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LMAN2Q12907 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms