Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMARCB1Q12824 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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