Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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