Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYP4F3Q08477 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms