Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FMODQ06828 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FMODQ06828 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FMODQ06828 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms