Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms