Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms