Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms