Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms