Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRG1Q02297 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRG1Q02297 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms