Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms