Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRT76Q01546 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT76Q01546 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms