Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms