Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms