Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms