Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBA1P69905 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms