Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms