Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms