Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP54P61011 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRP54P61011 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRP54P61011 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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