Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ACTBP60709 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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