Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBASH3AP57075 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms