Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BACE1P56817 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms