Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
OXCT1P55809 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OXCT1P55809 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms