Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms