Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23BP54727 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms