Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3M2P53677 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3M2P53677 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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