Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA5P52803 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms