Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMSP52788 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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