Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms