Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSRP3P50461 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms