Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms