Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRT6CP48668 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms