Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RANGAP1P46060 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANGAP1P46060 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms