Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.6 ms