Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A2P43004 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 522.8 ms