Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETFBP38117 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ETFBP38117 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ETFBP38117 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ETFBP38117 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ETFBP38117 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ETFBP38117 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETFBP38117 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETFBP38117 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms