Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJC1P36383 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms