Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB3P28472 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms