Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms