Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms