Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALB2P22676 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALB2P22676 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms