Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNFRSF1BP20333 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF1BP20333 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNFRSF1BP20333 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNFRSF1BP20333 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNFRSF1BP20333 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNFRSF1BP20333 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNFRSF1BP20333 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNFRSF1BP20333 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TNFRSF1BP20333 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TNFRSF1BP20333 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TNFRSF1BP20333 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF1BP20333 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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